Nature Genetics杂志2015年3月9日在线发表文章《对超过12万名个体的全基因组关联分析新发现15个乳腺癌易感位点》。

　　通过全基因组关联分析（GWAS）和大规模复制研究等手段，目前已经发现了79个与乳腺癌相关的位点，大约能够解释该病遗传风险的约14%。这项研究由英国癌症研究中心资助，其目的是发现更多新的易感位点。癌症基因-环境联合研究协会旗下的乳腺癌研究联盟中来自全球各地的几十位科学家共同完成了这项研究。研究者们对11项GWAS进行了荟萃分析，比较了12万名欧洲血统女性的基因组成，对比其中乳腺癌患者和非乳腺癌人群间基因组成的细微差异。分析对象包括15 748例乳腺癌病例和18 084例对照，以及41项研究中经由211 155标志物定制检测（iCOGS）进行了基因分型的46 785例乳腺癌病例和42 892例对照。研究者们使用1000基因工程参考面板对1100多万个单核苷酸多态性（SNP）进行基因分型，最终发现了15个与乳腺癌患病风险增加有关的SNP，P＜5×10^-8。这样，与乳腺癌相关的易感位点达到了94个。

　　虽然每个位点对乳腺癌风险增加的贡献很小，但有些患者可能会携带多个位点，使得其发病风险显著增加。例如在英国，大约每8位女性中有1位会在某个年龄患上乳腺癌。但有一定比例的女性携带一定数量的遗传变异，使其乳腺癌患病风险翻倍，研究者估计这个比例约为5%。换言之，在这5%的女性中，每4个人就会有1人患乳腺癌。而又有约0.7%的女性携带的遗传变异使其风险进一步升高，达1/3左右。

　　此外研究者使用乳腺细胞系的ChiP-seq染色质结合数据和来自ENCODE的ChiA-PET染色质相互作用数据进行了结合关联分析，发现了两个可能的靶向基因，分别是位于18去2.3的SETBP1和位于1q21.1的RNF115基因。

　　来自剑桥大学的遗传流行病学教授Doug Easton为文章的通讯作者，在他看来，下一步工作是要探索这些遗传变异增加乳腺癌风险的机制。而且他确定，还会有更多遗传变异等待被发现。