编者按：2023年ESMO靶向抗癌治疗大会（ESMO TAT Congress）于3月6-8日在法国巴黎举行，3月6日举行的微型口头报告专场的主题为“开发和实施精准治疗的最佳工具和方法”。二代测序（NGS）对于实施精准治疗具有重要意义，然而NGS基因组结果的解读和报告是一个关键问题，研究人员探索了满足这一需求的新工具和方法。

 

分子检测在癌症患者的诊断和临床管理中发挥着核心作用，而二代测序（NGS）是现有医疗设备中的关键武器。NGS使用极低的核酸输入量，使我们能够同时评估不同患者的不同生物标志物，从而从根本上改变了分子预测医学的实施方式（Cytopathology.2021;32:588–595）。NGS对靶向治疗的意义巨大，尤其是对于晚期癌症，对于这部分不可忽视的患者，通常只能获取很少量的组织样本用于形态分子研究（J Clin Pathol.2017;70:819-826）。除了组织样本，NGS还可用于液体活检样本的分析。

 

 

尽管NGS检测在多个领域很有前景，但高昂的成本仍然是NGS应用于日常临床实践的主要障碍。然而，KWAY研究表明，与标准的单基因检测模式相比，最大化的NGS方法节省了工作人员用于检测的时间，并降低了每例患者的总检测成本（Crit Rev Oncol Hematol.2022;169:103525）。

 

使用NGS时的另一个关键问题是，如何报告患者的基因组信息——因为目前可用的基因面板具有高度变异性，从仅覆盖临床相关基因变异的最小基因面板到包含人类癌症的所有基因的最广泛基因面板（Br J Cancer.2017;116:553-560）。采用特定工具是解读不同基因组变异和仅报告临床医师在癌症患者治疗中可能感兴趣的基因变异的基础（JCO Precis Oncol.2017;2017:PO.17.00011;Int J Cancer.2019;145:2996–3010;Ann Oncol.2018;29:1895–1902）。正如2023年ESMO靶向抗癌治疗大会（ESMO TAT）展示的Botticelli等人（摘要号70MO）和Crimini等人（摘要号71P）的研究所强调的那样，研究人员的工作集中在寻找满足这一需求的新工具和方法。

 

随机II期Rome试验（NCT04591431）在转移性实体瘤患者中利用广泛基因组分析（EGP）结果将患者随机分组，分别接受相关靶向治疗或该肿瘤类型的标准治疗(NCT04591431)。组织(采集时间<6个月)和血液样本通过集中NGS分析，EGP结果由分子肿瘤委员会（MTB）进行讨论，携带至少有一种个体化治疗药物的突变的患者被1:1随机分配接受个体化治疗或标准治疗。2023 ESMO TAT报告了EGP前两年的结果及其对MTB讨论的影响（摘要号70MO）。

 

Rome试验纳入了1319例乳腺癌、胃肠道(非结直肠癌)、肺癌或其他癌症患者，大多数(85%)通过组织和液体活检进行了EGP，最常见的突变基因是TP53(53%)，其次是KRAS(27%)、CDKN2A/B(20%)、APC(17%)、PIK3CA(17%)、PTEN(13%)、ERBB2(10%)、NRAS(11%)和MTAP(11%)；4%患者的肿瘤具有微卫星不稳定性（MSI），76%和20%的微卫星稳定型(MSS)肿瘤<10个突变/Mb和>10个突变/Mb。在根据EGP和MTB讨论分配到治疗组的患者中，316例(24%)有可作为治疗靶点的突变的患者被随机分配到相关靶向药物治疗组或标准治疗组。虽然167例患者没有可靶向治疗的基因改变，但MTB讨论导致他们转诊接受另一项试验(n=58)，修改了标准治疗(n=28)，或者在有潜在生殖细胞系变异的情况下，接受了遗传咨询(n=81)。研究结果表明EGP和MTB讨论在分配患者接受适当的靶向治疗方面对约34%的患者有用。

 

ROME试验的大量基因组分析结果(ESMO TAT 2023，摘要70MO)

 

摘要71P报告了意大利首次在临床实践中应用MTB的真实世界数据。MTB讨论了251例癌症患者，包括26种不同的原发癌症类型。经MTB讨论后，76例患者接受分子匹配治疗(MMT)，76例接受非匹配治疗(nMMT)。接受MMT的患者有更高的总体缓解率(37.3%vs 12.9%)、中位无进展生存期(mPFS:5.8个月vs 3.6个月；HR=0.679，p=0.041)和中位总生存期(mOS:35.1个月vs 8.5个月；HR=0.431，p=0.002)。在多变量模型中，OS和PFS的优势持续存在。结果表明，MTB可以在OS和PFS方面产生有价值的临床获益。

 

然而，除了使用新技术和更可持续的方法之外，分子肿瘤委员会（MTB由多学科专家组成）显然是这一情况下真正的游戏规则改变者，它可能有助于揭示NGS发现的基因变异的临床意义，并确定最适当治疗患者的方法（Nat Commun.2020;11:4965）。

 

参考文献

 

1.Botticelli A E，et al.Genomic profiling to expand precision cancer medicine in the real world:The ROME trial.ESMO Targeted Anticancer Therapies Congress 2023，Abstract 70MO

 

2.Crimini E，et al.Molecular Tumor Board at the European Institute of Oncology:An early Italian precision oncology experience.ESMO Targeted Anticancer Therapies Congress 2023，Abstract 71P